通過 "蛋白質組學HLA配體組分析 "對呈現在HLA上的肽進行全面分析

札幌醫科大學于9月28日宣布，它已經發現一部分未翻譯的RNA被翻譯成片段并呈現在癌細胞表面，使其成為T淋巴細胞的目標。 這項研究是由該大學病理一系的鳥越俊彥教授和金瀨孝之講師領導的研究小組進行的。 該研究結果已發表在《癌癥免疫學研究》上。

已經證明，當被人類免疫細胞(細胞毒性T淋巴細胞)攻擊時，癌癥會消退。 新的癌癥藥物，即免疫檢查點抑制劑，就是基于這種機制。 然而，人們對哪些分子(抗原)被淋巴細胞識別以優先攻擊癌細胞還不是很清楚。

該研究小組利用蛋白質組學技術來解決這個問題。 人類細胞轉錄了大量的非翻譯RNA，這些RNA被認為是不制造蛋白質的。 在這項研究中，我們專注于長的非翻譯RNAs，并測試了它們作為淋巴細胞靶點的潛力。 我們使用了一種名為 "蛋白質基因組學HLA配體組分析 "的新技術，它將質譜分析與下一代測序相結合。 傳統的蛋白質組學只搜索數據庫中的已知蛋白質序列，而蛋白質基因組學是基于樣本基因信息，可以包括數據庫中沒有的序列。 HLA配體組分析是一種提取和全面測序細胞HLA上呈現的肽的新技術。

長的非翻譯RNA PVT1被翻譯成片段并呈現在癌細胞的表面。

對結直腸癌組織的分析顯示，片段翻譯發生于一種名為PPVT1的長非翻譯RNA，它呈現在癌細胞的表面。 PVT1是長非翻譯RNA之一，位于基因組中癌基因Myc的下游。 PVT1是基因組中最長的非翻譯RNA之一。

此外，在幾個結直腸癌患者的組織中檢測到了識別PVT1肽的CD8+T淋巴細胞，證實這些T淋巴細胞能準確識別和攻擊癌細胞。

PVT1被認為是一種致癌基因，在許多結直腸癌組織中表達。 鳥越教授和他的同事正在與制藥公司合作，開發用于治療結直腸癌的人工抗體和轉基因淋巴細胞。 Torigoe和他的同事們還在與制藥公司合作，開發用于治療結腸直腸癌的人工抗體和轉基因淋巴細胞。"我們還在利用新冠狀病毒疫苗中使用的mRNA疫苗技術開發預防癌癥的疫苗，"該小組說。